Informácie o serveri DGX

Toto je len testovacia verzia!

Server je momentálne v testovacej prevádzke a zdroje zatiaľ nie sú obmedzené. Prosíme používateľov, aby si pridávali len toľko výpočtového výkonu, koľko budú reálne potrebovať.

Dotazník na dodatočnú výpočtovú kapacitu HPC: klikni tu

Pre žiadosti o prístup alebo riešenie problémov píšte na dgx@helpdesk.tuke.sk.

1. Informácie o serveri

Popis	Ubuntu 24.04.2 LTS
CPU	256 jadier
RAM	1.0 TiB
Počet GPU	8
Model GPU	NVIDIA A100-SXM4-40GB
Pamäť na jednu GPU	40 GB

2. Ako sa pripojiť pomocou SSH (Putty)

Na pripojenie k serveru použite Putty, ktorý si môžete stiahnuť z oficiálnej stránky.

ssh jedinečny_login@dgx.uvt.tuke.sk

3. Prenos súborov pomocou WinSCP

Na prenos súborov môžete použiť WinSCP, ktorý si môžete stiahnuť tu.

Hostiteľ: dgx.uvt.tuke.sk
Používateľ: jedinečny_login
Protokol: SCP alebo SFTP
    

4. SLURM

Základné príkazy pre správu úloh

• sbatch job.slurm - Odoslanie úlohy do frontu.
• squeue - Zobrazenie fronty úloh.
• scancel JOB_ID - Zrušenie úlohy podľa ID.
• sinfo - Informácie o dostupných uzloch a partíciách.
• seff JOB_ID - Zobrazenie efektivity vykonanej úlohy.

Užitočné rozšírené príkazy

• srun --pty bash – spustenie interaktívnej relácie v clustri.
• sacct -j JOB_ID – zobrazenie histórie a účtovných štatistík úlohy.
• scontrol show job JOB_ID – detailné informácie o úlohe.
• module avail – zoznam dostupných modulov (napr. Python, CUDA).
• module load <modul> – načítanie modulu, napr. module load python/3.9.
• nvidia-smi – monitorovanie využitia GPU.
• watch -n 5 nvidia-smi – priebežné sledovanie stavu GPU každých 5 s.
• htop – interaktívny prehliadač procesov (balík htop).
• df -h – zobrazenie využitia diskového priestoru.

Testovací SLURM skript

#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=test_python  # Názov úlohy
#SBATCH --output=output.log     # Súbor pre výstup
#SBATCH --error=error.log       # Súbor pre chybové hlásenia
#SBATCH --partition=dgx         # Použitie GPU partície
#SBATCH --gres=gpu:1            # Pridelenie jednej GPU
#SBATCH --cpus-per-task=4       # Počet CPU jadier na jednu úlohu
#SBATCH --mem=16G               # Alokovaná pamäť pre úlohu
#SBATCH --time=01:00:00         # Maximálny čas behu (1 hodina)

source ~/miniconda3/bin/activate myenv  # Aktivácia Conda prostredia
python skript.py                       # Spustenie Python skriptu
    

Generátor SLURM skriptu

Pre rýchle generovanie vlastného SLURM skriptu otvorte:

Otvoriť generátor

5. ANACONDA

Inštalácia Miniconda

wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

# Vytvorenie nového prostredia
conda create --name moje_prostredie python=3.8

# Aktivácia prostredia
conda activate moje_prostredie

# Inštalácia balíčkov
conda install numpy pandas matplotlib

# Deaktivácia prostredia
deactivate

# Odstránenie prostredia
conda remove --name moje_prostredie --all
    

Stránka sa bude postupne aktualizovať. V prípade nápadov nás neváhajte kontaktovať.